Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD3BQ5T9A4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3BQ5T9A4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATAD3BQ5T9A4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATAD3BQ5T9A4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATAD3BQ5T9A4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3BQ5T9A4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3BQ5T9A4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3BQ5T9A4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3BQ5T9A4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3BQ5T9A4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3BQ5T9A4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3BQ5T9A4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3BQ5T9A4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3BQ5T9A4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATAD3BQ5T9A4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATAD3BQ5T9A4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms