Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P3

LCE1B, Late cornified envelope protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE1BQ5T7P3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LCE1BQ5T7P3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms