Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC27Q2M243 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC27Q2M243 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC27Q2M243 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC27Q2M243 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC27Q2M243 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC27Q2M243 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC27Q2M243 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC27Q2M243 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC27Q2M243 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC27Q2M243 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC27Q2M243 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC27Q2M243 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC27Q2M243 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC27Q2M243 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC27Q2M243 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC27Q2M243 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC27Q2M243 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC27Q2M243 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms