Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC41Q15345 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC41Q15345 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC41Q15345 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC41Q15345 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms