Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTPRKQ15262 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.7■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PTPRKQ15262 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
PTPRKQ15262 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PTPRKQ15262 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPRKQ15262 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms