Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFRLQ15198 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDGFRLQ15198 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDGFRLQ15198 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDGFRLQ15198 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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