Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 KSS1YGR040W 1107 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 REV7YIL139C 738 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 YLL047WYLL047W 384 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 YML094C-AYML094C-A 402 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 RRT1YBL048W 312 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 PHA2YNL316C 1005 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 SNX3YOR357C 489 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 HEM14YER014W 1620 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 YHR177WYHR177W 1362 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 CDC10YCR002C 969 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 YDR124WYDR124W 975 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 YEL008WYEL008W 381 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 YGL214WYGL214W 486 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 OPI3YJR073C 621 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 MMM1YLL006W 1281 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 YOR364WYOR364W 369 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 JID1YPR061C 906 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 IFA38YBR159W 1044 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 YFL052WYFL052W 1398 nt7.71□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 ATG23YLR431C 1362 nt7.71□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 CTF18YMR078C 2226 nt7.71□□□□□ -1.17
TY1A-BLQ12266 INH1YDL181W 258 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 YDR336WYDR336W 945 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 YEA6YEL006W 1008 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 IME1YJR094C 1083 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 YNR025CYNR025C 360 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 GPM3YOL056W 912 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 CTI6YPL181W 1521 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 RHO3YIL118W 696 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 YJR114WYJR114W 393 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 SEN2YLR105C 1134 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 JNM1YMR294W 1122 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 GPI2YPL076W 843 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 LEU4YNL104C 1860 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 YCR006CYCR006C 474 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 COX2Q0250 756 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 RFM1YOR279C 933 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 SCP1YOR367W 603 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 HIM1YDR317W 1245 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 LSM6YDR378C 261 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 SNF4YGL115W 969 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 SPS100YHR139C 981 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 YNR064CYNR064C 873 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 MEK1YOR351C 1494 nt7.68□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 YDL016CYDL016C 303 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 KXD1YGL079W 657 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 MRPL13YKR006C 795 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 YLR365WYLR365W 333 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 IES2YNL215W 963 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 ALG5YPL227C 1005 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 IML3YBR107C 738 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 APM3YBR288C 1452 nt7.67□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 TRP1YDR007W 675 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 URA5YML106W 681 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 DOM34YNL001W 1161 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 RRP14YKL082C 1305 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 ERG24YNL280C 1317 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 TFC7YOR110W 1308 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 YMR265CYMR265C 1386 nt7.66□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 SPO12YHR152W 522 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 CPR7YJR032W 1182 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 YLR349WYLR349W 507 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 PRE7YBL041W 726 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 USV1YPL230W 1176 nt7.65□□□□□ -1.18
TY1A-BLQ12266 SUV3YPL029W 2214 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 YPR084WYPR084W 1371 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 NMA2YGR010W 1188 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 YIL168WYIL168W 384 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 YJL032WYJL032W 315 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 SRP21YKL122C 504 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 MRP7YNL005C 1116 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 MTQ1YNL063W 945 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 SCD6YPR129W 1050 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 SFL1YOR140W 2301 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 FET5YFL041W 1869 nt7.64□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 YLR108CYLR108C 1458 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 MAS1YLR163C 1389 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 PCL2YDL127W 927 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 SRG1SRG1 551 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 RAV2YDR202C 1056 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 YFT2YDR319C 825 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 ERG25YGR060W 930 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 SAY1YGR263C 1275 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 IPI1YHR085W 1005 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 MPM1YJL066C 759 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 YUR1YJL139C 1287 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 YAL066WYAL066W 309 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 MHF1YOL086W-A 273 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 HRT1YOL133W 366 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 LDH1YBR204C 1128 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 MEX67YPL169C 1800 nt7.63□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 NPP2YEL016C 1482 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.62□□□□□ -1.19
TY1A-BLQ12266 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.62□□□□□ -1.19
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