Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RASGEF1BQ0VAM2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASGEF1BQ0VAM2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RASGEF1BQ0VAM2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RASGEF1BQ0VAM2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms