Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 COQ3YOL096C 939 nt8.1□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 PTC7YHR076W 1032 nt8.09□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 YOR200WYOR200W 399 nt8.09□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 YBR027CYBR027C 333 nt8.09□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 TAE1YBR261C 699 nt8.09□□□□□ -1.11
SYF1Q04048 FRT1YOR324C 1809 nt8.08□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 CUE4YML101C 354 nt8.08□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 LIP5YOR196C 1245 nt8.08□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 THR1YHR025W 1074 nt8.07□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 MGM101YJR144W 810 nt8.07□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 MHT1YLL062C 975 nt8.07□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 RNH1YMR234W 1047 nt8.07□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 SGF73YGL066W 1974 nt8.07□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 MRPS28YDR337W 861 nt8.06□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 HPT1YDR399W 666 nt8.06□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 VMA3YEL027W 483 nt8.06□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 MDH2YOL126C 1134 nt8.06□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 CTA1YDR256C 1548 nt8.06□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 SNU66YOR308C 1764 nt8.06□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 YHR131CYHR131C 2553 nt8.05□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 CUP2YGL166W 678 nt8.05□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 PRE3YJL001W 648 nt8.05□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 YKR045CYKR045C 552 nt8.05□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 YMR295CYMR295C 594 nt8.05□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 SEC62YPL094C 825 nt8.05□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt8.04□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 VBA5YKR105C 1749 nt8.03□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 MSP1YGR028W 1089 nt8.03□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 YKL077WYKL077W 1179 nt8.03□□□□□ -1.12
SYF1Q04048 IRC7YFR055W 1023 nt8.02□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 AFG2YLR397C 2343 nt8.02□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 UIP5YKR044W 1332 nt8.02□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 ZWF1YNL241C 1518 nt8□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 HED1YDR014W-A 489 nt8□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 SWD1YAR003W 1281 nt8□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt8□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.99□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 RPL31BYLR406C 342 nt7.99□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 SPG5YMR191W 1122 nt7.99□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 MSS51YLR203C 1311 nt7.99□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 NDE1YMR145C 1683 nt7.98□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 GNA1YFL017C 480 nt7.98□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 MRPL10YNL284C 969 nt7.98□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 PMT7YDR307W 1989 nt7.98□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 FPR3YML074C 1236 nt7.97□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 AIM34YMR003W 597 nt7.97□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt7.97□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 PHO85YPL031C 918 nt7.97□□□□□ -1.13
SYF1Q04048 DOT1YDR440W 1749 nt7.96□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 MPC2YHR162W 390 nt7.96□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 SCS7YMR272C 1155 nt7.96□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 MRPL23YOR150W 492 nt7.96□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 ADH5YBR145W 1056 nt7.96□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 DLD1YDL174C 1764 nt7.96□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 ECM27YJR106W 2178 nt7.95□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 YOR041CYOR041C 432 nt7.95□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 RPS28AYOR167C 204 nt7.95□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 PFS2YNL317W 1398 nt7.95□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 MHP1YJL042W 4197 nt7.95□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.94□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 YRB2YIL063C 984 nt7.94□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 YAR064WYAR064W 300 nt7.94□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 YPR127WYPR127W 1038 nt7.94□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 YJL045WYJL045W 1905 nt7.93□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 GGC1YDL198C 903 nt7.93□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 TMA46YOR091W 1038 nt7.93□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 CCR4YAL021C 2514 nt7.93□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 ITR1YDR497C 1755 nt7.92□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 PEX3YDR329C 1326 nt7.92□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 DSF1YEL070W 1509 nt7.92□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 YHK8YHR048W 1545 nt7.92□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 YNR073CYNR073C 1509 nt7.92□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 FCP1YMR277W 2199 nt7.91□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 CTF3YLR381W 2202 nt7.91□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.91□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.91□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.91□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 UIP4YPL186C 915 nt7.91□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 BEM1YBR200W 1656 nt7.91□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 ZRT2YLR130C 1269 nt7.9□□□□□ -1.14
SYF1Q04048 EXG2YDR261C 1689 nt7.89□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 PPH22YDL188C 1134 nt7.89□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 YMR279CYMR279C 1623 nt7.89□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 IRC5YFR038W 2562 nt7.88□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 MAL31YBR298C 1845 nt7.88□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 CCT8YJL008C 1707 nt7.88□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 MSG5YNL053W 1470 nt7.87□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 HVG1YER039C 750 nt7.87□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 MOG1YJR074W 657 nt7.87□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 CDC23YHR166C 1881 nt7.87□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 YIL108WYIL108W 2091 nt7.87□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 NUP57YGR119C 1626 nt7.86□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 HSV2YGR223C 1347 nt7.86□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 YMR034CYMR034C 1305 nt7.86□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 CBR1YIL043C 855 nt7.86□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 TIF2YJL138C 1188 nt7.86□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 TIF1YKR059W 1188 nt7.86□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 MIX17YMR002W 471 nt7.86□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 LYS21YDL131W 1323 nt7.85□□□□□ -1.15
SYF1Q04048 YEL023CYEL023C 2049 nt7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.4 ms