Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREMQ03060 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREMQ03060 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREMQ03060 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREMQ03060 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREMQ03060 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREMQ03060 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREMQ03060 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CREMQ03060 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREMQ03060 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREMQ03060 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREMQ03060 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CREMQ03060 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREMQ03060 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREMQ03060 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREMQ03060 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CREMQ03060 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CREMQ03060 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREMQ03060 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CREMQ03060 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREMQ03060 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREMQ03060 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CREMQ03060 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREMQ03060 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CREMQ03060 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CREMQ03060 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CREMQ03060 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CREMQ03060 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CREMQ03060 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CREMQ03060 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CREMQ03060 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CREMQ03060 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CREMQ03060 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CREMQ03060 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CREMQ03060 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREMQ03060 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREMQ03060 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREMQ03060 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREMQ03060 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREMQ03060 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREMQ03060 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CREMQ03060 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CREMQ03060 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREMQ03060 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREMQ03060 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREMQ03060 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CREMQ03060 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CREMQ03060 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREMQ03060 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREMQ03060 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREMQ03060 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREMQ03060 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CREMQ03060 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CREMQ03060 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREMQ03060 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREMQ03060 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREMQ03060 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREMQ03060 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREMQ03060 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREMQ03060 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CREMQ03060 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CREMQ03060 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CREMQ03060 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CREMQ03060 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CREMQ03060 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CREMQ03060 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CREMQ03060 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CREMQ03060 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CREMQ03060 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CREMQ03060 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREMQ03060 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREMQ03060 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CREMQ03060 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREMQ03060 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CREMQ03060 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREMQ03060 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREMQ03060 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREMQ03060 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREMQ03060 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CREMQ03060 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREMQ03060 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREMQ03060 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREMQ03060 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREMQ03060 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREMQ03060 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREMQ03060 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREMQ03060 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CREMQ03060 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREMQ03060 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREMQ03060 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREMQ03060 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREMQ03060 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms