Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms