Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDLBPQ00341 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDLBPQ00341 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDLBPQ00341 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDLBPQ00341 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDLBPQ00341 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDLBPQ00341 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
HDLBPQ00341 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDLBPQ00341 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDLBPQ00341 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDLBPQ00341 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HDLBPQ00341 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HDLBPQ00341 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
HDLBPQ00341 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HDLBPQ00341 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDLBPQ00341 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDLBPQ00341 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms