Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SKOR1P84550 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SKOR1P84550 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SKOR1P84550 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKOR1P84550 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms