Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTG1P63261 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTG1P63261 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTG1P63261 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTG1P63261 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTG1P63261 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTG1P63261 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTG1P63261 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTG1P63261 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTG1P63261 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTG1P63261 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTG1P63261 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTG1P63261 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTG1P63261 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTG1P63261 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTG1P63261 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACTG1P63261 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTG1P63261 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTG1P63261 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTG1P63261 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTG1P63261 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTG1P63261 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTG1P63261 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTG1P63261 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTG1P63261 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTG1P63261 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTG1P63261 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTG1P63261 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTG1P63261 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTG1P63261 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTG1P63261 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTG1P63261 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTG1P63261 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTG1P63261 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTG1P63261 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms