Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEFA3P59666 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEFA3P59666 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DEFA3P59666 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DEFA3P59666 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEFA3P59666 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEFA3P59666 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DEFA3P59666 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEFA3P59666 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEFA3P59666 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DEFA3P59666 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DEFA3P59666 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DEFA3P59666 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms