Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDST2P52849 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NDST2P52849 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDST2P52849 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDST2P52849 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NDST2P52849 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDST2P52849 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDST2P52849 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NDST2P52849 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDST2P52849 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDST2P52849 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NDST2P52849 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST2P52849 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST2P52849 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST2P52849 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST2P52849 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST2P52849 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST2P52849 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NDST2P52849 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST2P52849 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST2P52849 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST2P52849 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST2P52849 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST2P52849 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST2P52849 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NDST2P52849 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDST2P52849 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NDST2P52849 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDST2P52849 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDST2P52849 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NDST2P52849 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDST2P52849 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDST2P52849 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NDST2P52849 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NDST2P52849 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST2P52849 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST2P52849 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST2P52849 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST2P52849 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NDST2P52849 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NDST2P52849 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDST2P52849 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDST2P52849 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDST2P52849 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDST2P52849 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDST2P52849 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NDST2P52849 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST2P52849 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST2P52849 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST2P52849 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST2P52849 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST2P52849 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST2P52849 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST2P52849 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST2P52849 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NDST2P52849 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDST2P52849 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDST2P52849 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NDST2P52849 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDST2P52849 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NDST2P52849 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDST2P52849 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDST2P52849 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NDST2P52849 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NDST2P52849 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NDST2P52849 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST2P52849 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST2P52849 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST2P52849 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST2P52849 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NDST2P52849 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDST2P52849 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NDST2P52849 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDST2P52849 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDST2P52849 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NDST2P52849 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NDST2P52849 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDST2P52849 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDST2P52849 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDST2P52849 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDST2P52849 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST2P52849 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST2P52849 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST2P52849 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST2P52849 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST2P52849 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDST2P52849 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDST2P52849 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDST2P52849 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDST2P52849 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDST2P52849 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDST2P52849 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NDST2P52849 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDST2P52849 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDST2P52849 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDST2P52849 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDST2P52849 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDST2P52849 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDST2P52849 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NDST2P52849 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms