Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC10.76□□□□□ -0.698e-19■■■■■ 36.2
HNRNPMP52272 RCL1-203ENST00000381732 804 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.556e-9■■■■■ 36.2
HNRNPMP52272 RCL1-209ENST00000473230 441 ntTSL 310.59□□□□□ -0.716e-9■■■■■ 36.2
HNRNPMP52272 CANX-208ENST00000504579 533 ntTSL 436.78■■■■□ 3.482e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 CANX-212ENST00000506654 592 ntTSL 336.78■■■■□ 3.482e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 CANX-213ENST00000507307 582 ntTSL 531.04■■■□□ 2.562e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 CANX-218ENST00000514032 1876 ntTSL 230.19■■■□□ 2.422e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 CANX-204ENST00000502498 570 ntTSL 429.32■■■□□ 2.282e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 CANX-217ENST00000513246 727 ntTSL 528.52■■■□□ 2.162e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 CANX-219ENST00000514383 585 ntTSL 328.02■■■□□ 2.082e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 CANX-216ENST00000510810 511 ntTSL 425.12■■□□□ 1.612e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 CANX-203ENST00000502296 825 ntTSL 424.81■■□□□ 1.562e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.152e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.982e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.672e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 USP1-203ENST00000442679 502 ntTSL 219.15■□□□□ 0.662e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 CANX-205ENST00000502673 1000 ntTSL 518.35■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 USP1-204ENST00000452143 893 ntTSL 317.56■□□□□ 0.42e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.252e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 USP1-201ENST00000339950 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.172e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 MTMR9-204ENST00000530200 3503 ntTSL 1 (best)14.86□□□□□ -0.032e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 LINC01399-201ENST00000423311 648 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.232e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 MTMR9-203ENST00000528389 1283 ntTSL 39.38□□□□□ -0.912e-9■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.824e-7■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.664e-7■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 EVI5-203ENST00000468580 654 ntTSL 56.13□□□□□ -1.431e-8■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 EVI5-205ENST00000491940 971 ntTSL 55.36□□□□□ -1.551e-8■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 EVI5-207ENST00000492613 495 ntTSL 34.09□□□□□ -1.751e-8■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 TYW1-206ENST00000495971 1302 ntTSL 216.37■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 TYW1-207ENST00000615572 3156 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 TYW1-202ENST00000361660 3255 ntTSL 1 (best)13.01□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 TYW1-201ENST00000359626 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.591e-7■■■■■ 36.1
HNRNPMP52272 CAMSAP1-205ENST00000468150 284 ntTSL 56.9□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 36
HNRNPMP52272 CAMSAP1-204ENST00000460094 371 ntTSL 25.74□□□□□ -1.491e-6■■■■■ 36
HNRNPMP52272 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.187e-7■■■■■ 36
HNRNPMP52272 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.077e-7■■■■■ 36
HNRNPMP52272 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.017e-7■■■■■ 36
HNRNPMP52272 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.347e-7■■■■■ 36
HNRNPMP52272 TUBGCP2-208ENST00000482278 3553 ntTSL 216.51■□□□□ 0.237e-7■■■■■ 36
HNRNPMP52272 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.017e-7■■■■■ 36
HNRNPMP52272 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.133e-13■■■■■ 35.9
HNRNPMP52272 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.528e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 ABCA11P-203ENST00000507854 1503 ntTSL 1 (best)15.35■□□□□ 0.057e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 ZNF721-206ENST00000515578 1679 ntTSL 1 (best)12.38□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 ABCA11P-201ENST00000451020 1815 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.497e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 ZNF721-202ENST00000505900 664 ntTSL 1 (best)11.28□□□□□ -0.68e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.647e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 ABCA11P-204ENST00000514396 1423 ntTSL 1 (best)10.12□□□□□ -0.797e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.038e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 ZNF721-204ENST00000507078 355 ntTSL 52.67□□□□□ -1.988e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.273e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 SLC20A2-212ENST00000523340 1265 ntTSL 238.31■■■■□ 3.722e-10■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 TBL1X-205ENST00000422314 496 ntTSL 237.33■■■■□ 3.571e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 SLC20A2-209ENST00000521455 411 ntTSL 329.28■■■□□ 2.282e-10■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.081e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 SLC20A2-214ENST00000524237 545 ntTSL 425.24■■□□□ 1.632e-10■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.022e-10■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 TBL1X-208ENST00000452824 387 ntTSL 518.1■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.42e-10■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 SLC20A2-205ENST00000518717 573 ntTSL 413.7□□□□□ -0.222e-10■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 SLC20A2-203ENST00000518384 557 ntTSL 412.37□□□□□ -0.432e-10■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 TBL1X-204ENST00000415293 565 ntTSL 510.07□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 TBL1X-207ENST00000441088 520 ntTSL 310.07□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 35.8
HNRNPMP52272 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.411e-8■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RALB-204ENST00000431732 767 ntTSL 536.34■■■■□ 3.411e-8■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RALB-207ENST00000470417 1931 ntTSL 335.77■■■■□ 3.321e-8■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.321e-8■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.661e-8■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RALB-206ENST00000449649 667 ntTSL 526.22■■□□□ 1.791e-8■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RALB-202ENST00000412383 981 ntTSL 325.49■■□□□ 1.671e-8■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RALB-205ENST00000447591 558 ntTSL 422■■□□□ 1.111e-8■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 SUN1-202ENST00000389574 3812 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 SUN1-219ENST00000452783 3717 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.881e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.561e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RPS9-206ENST00000436445 752 ntTSL 222.68■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RPS9-208ENST00000445961 944 ntTSL 522.68■■□□□ 1.221e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RPS9-211ENST00000484121 897 ntTSL 221.75■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RPS9-209ENST00000448962 2384 ntTSL 221.52■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 RPS9-212ENST00000495002 956 ntTSL 1 (best)18.86■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 ZNF280B-202ENST00000619852 3981 ntTSL 1 (best)13.02□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 MIR595-201ENST00000384905 96 ntBASIC12.65□□□□□ -0.388e-9■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.847e-7■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 LAMP1-203ENST00000472564 5242 ntTSL 221.82■■□□□ 1.087e-7■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.792e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 SOD2-209ENST00000535561 551 ntTSL 322.34■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 SOD2-204ENST00000401980 523 ntTSL 419.98■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 SOD2-214ENST00000545162 571 ntTSL 318.55■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 35.7
HNRNPMP52272 SOD2-210ENST00000537657 507 ntTSL 216.23■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 35.7
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 405.7 ms