Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK3P49761 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK3P49761 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK3P49761 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK3P49761 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK3P49761 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK3P49761 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK3P49761 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK3P49761 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK3P49761 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK3P49761 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK3P49761 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK3P49761 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK3P49761 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLK3P49761 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK3P49761 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK3P49761 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK3P49761 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK3P49761 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLK3P49761 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK3P49761 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK3P49761 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK3P49761 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK3P49761 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK3P49761 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLK3P49761 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK3P49761 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK3P49761 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK3P49761 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK3P49761 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLK3P49761 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK3P49761 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK3P49761 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK3P49761 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK3P49761 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK3P49761 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK3P49761 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLK3P49761 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLK3P49761 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK3P49761 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK3P49761 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK3P49761 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLK3P49761 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK3P49761 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK3P49761 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK3P49761 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK3P49761 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLK3P49761 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK3P49761 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK3P49761 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK3P49761 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK3P49761 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK3P49761 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK3P49761 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK3P49761 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK3P49761 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK3P49761 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK3P49761 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLK3P49761 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK3P49761 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK3P49761 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK3P49761 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLK3P49761 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLK3P49761 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CLK3P49761 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLK3P49761 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK3P49761 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK3P49761 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK3P49761 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK3P49761 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLK3P49761 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK3P49761 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK3P49761 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK3P49761 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK3P49761 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK3P49761 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK3P49761 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK3P49761 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK3P49761 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK3P49761 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLK3P49761 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK3P49761 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK3P49761 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK3P49761 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK3P49761 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK3P49761 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLK3P49761 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK3P49761 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLK3P49761 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK3P49761 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK3P49761 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLK3P49761 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK3P49761 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLK3P49761 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLK3P49761 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK3P49761 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK3P49761 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK3P49761 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK3P49761 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLK3P49761 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms