Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTSKP43235 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTSKP43235 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTSKP43235 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTSKP43235 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CTSKP43235 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CTSKP43235 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSKP43235 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSKP43235 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSKP43235 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSKP43235 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSKP43235 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSKP43235 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSKP43235 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSKP43235 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSKP43235 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSKP43235 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSKP43235 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSKP43235 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSKP43235 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSKP43235 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSKP43235 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSKP43235 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSKP43235 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSKP43235 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSKP43235 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSKP43235 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSKP43235 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSKP43235 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSKP43235 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSKP43235 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSKP43235 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSKP43235 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSKP43235 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSKP43235 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSKP43235 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSKP43235 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSKP43235 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSKP43235 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSKP43235 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSKP43235 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSKP43235 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSKP43235 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSKP43235 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSKP43235 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSKP43235 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSKP43235 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSKP43235 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSKP43235 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSKP43235 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSKP43235 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSKP43235 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSKP43235 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSKP43235 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTSKP43235 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSKP43235 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSKP43235 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSKP43235 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSKP43235 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSKP43235 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTSKP43235 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSKP43235 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSKP43235 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTSKP43235 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSKP43235 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSKP43235 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSKP43235 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTSKP43235 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSKP43235 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSKP43235 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSKP43235 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSKP43235 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSKP43235 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTSKP43235 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSKP43235 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSKP43235 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSKP43235 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSKP43235 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSKP43235 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTSKP43235 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSKP43235 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSKP43235 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSKP43235 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSKP43235 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTSKP43235 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSKP43235 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSKP43235 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTSKP43235 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSKP43235 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSKP43235 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSKP43235 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CTSKP43235 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTSKP43235 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTSKP43235 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSKP43235 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSKP43235 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTSKP43235 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSKP43235 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSKP43235 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSKP43235 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms