Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 PAC2YER007W 1557 nt7.44□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 NAF1YNL124W 1479 nt7.43□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 SLA2YNL243W 2907 nt7.43□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 YLL066CYLL066C 3618 nt7.43□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 snR30snR30 606 nt7.43□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 HXT13YEL069C 1695 nt7.43□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 RGD2YFL047W 2145 nt7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 CIA1YDR267C 993 nt7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 TRS31YDR472W 852 nt7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 YLR162WYLR162W 357 nt7.42□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 REC107YJR021C 945 nt7.41□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 YNR014WYNR014W 639 nt7.41□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 NTG2YOL043C 1143 nt7.41□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 URH1YDR400W 1023 nt7.4□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 ERG10YPL028W 1197 nt7.4□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 YCL049CYCL049C 939 nt7.4□□□□□ -1.22
SHQ1P40486 CBR1YIL043C 855 nt7.39□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 RPL31BYLR406C 342 nt7.39□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 SPG5YMR191W 1122 nt7.39□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 YNR005CYNR005C 405 nt7.39□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 SSC1YJR045C 1965 nt7.39□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 YIP4YGL198W 708 nt7.38□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 COX16YJL003W 357 nt7.38□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 HTZ1YOL012C 405 nt7.38□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 CDC13YDL220C 2775 nt7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 MPH3YJR160C 1809 nt7.37□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 BIO3YNR058W 1443 nt7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 YLL058WYLL058W 1728 nt7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 SMK1YPR054W 1167 nt7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 ECM27YJR106W 2178 nt7.36□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 VBA5YKR105C 1749 nt7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 OPI11YPR044C 354 nt7.35□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 CYS4YGR155W 1524 nt7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 TRR1YDR353W 960 nt7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 DYS1YHR068W 1164 nt7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 SRY1YKL218C 981 nt7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 LDB7YBL006C 543 nt7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 RRN10YBL025W 438 nt7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 APE4YHR113W 1473 nt7.34□□□□□ -1.23
SHQ1P40486 PEX31YGR004W 1389 nt7.33□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 PPH22YDL188C 1134 nt7.33□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 PTC7YHR076W 1032 nt7.33□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 MEU1YLR017W 1014 nt7.33□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 RPL5YPL131W 894 nt7.33□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 YPR076WYPR076W 375 nt7.33□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 MIP1YOR330C 3765 nt7.33□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 YJL163CYJL163C 1668 nt7.32□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 COX15YER141W 1461 nt7.32□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 YOL046CYOL046C 675 nt7.32□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 YDL177CYDL177C 513 nt7.31□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 MRPS28YDR337W 861 nt7.31□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 FCY22YER060W-A 1593 nt7.3□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 YSC83YHR017W 1158 nt7.3□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 HOC1YJR075W 1191 nt7.3□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 OPI8YKR035C 642 nt7.3□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 ECM38YLR299W 1983 nt7.29□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 LIA1YJR070C 978 nt7.29□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 IRC11YOR013W 471 nt7.29□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 FIT2YOR382W 462 nt7.29□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 SMX3YPR182W 261 nt7.29□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 YHR131CYHR131C 2553 nt7.29□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 MSB3YNL293W 1902 nt7.29□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 HSP12YFL014W 330 nt7.28□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 YGL102CYGL102C 429 nt7.28□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 YMR034CYMR034C 1305 nt7.27□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 CMK2YOL016C 1344 nt7.27□□□□□ -1.24
SHQ1P40486 GPD1YDL022W 1176 nt7.27□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 PRI1YIR008C 1230 nt7.27□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 ICP55YER078C 1536 nt7.27□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 PPH21YDL134C 1110 nt7.26□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 SEC62YPL094C 825 nt7.26□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 MSC3YLR219W 2187 nt7.26□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 BDF2YDL070W 1917 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 SUF16tG(GCC)C 71 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 SUF20tG(GCC)F1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 SUF23tG(GCC)J2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 SUF17tG(GCC)O2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 YJR107WYJR107W 987 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 GCN3YKR026C 918 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 TOS6YNL300W 309 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 ADH5YBR145W 1056 nt7.25□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 YHR020WYHR020W 2067 nt7.24□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 ICL2YPR006C 1728 nt7.24□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 STT3YGL022W 2157 nt7.23□□□□□ -1.25
SHQ1P40486 HED1YDR014W-A 489 nt7.23□□□□□ -1.25
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