Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 YLR162WYLR162W 357 nt5.81□□□□□ -1.48
CCS1P40202 PRE5YMR314W 705 nt5.81□□□□□ -1.48
CCS1P40202 YCL049CYCL049C 939 nt5.81□□□□□ -1.48
CCS1P40202 PAC2YER007W 1557 nt5.8□□□□□ -1.48
CCS1P40202 SSC1YJR045C 1965 nt5.8□□□□□ -1.48
CCS1P40202 PRP2YNR011C 2631 nt5.8□□□□□ -1.48
CCS1P40202 VBA5YKR105C 1749 nt5.79□□□□□ -1.48
CCS1P40202 YOR389WYOR389W 1875 nt5.79□□□□□ -1.48
CCS1P40202 YMR034CYMR034C 1305 nt5.79□□□□□ -1.48
CCS1P40202 SEC23YPR181C 2307 nt5.79□□□□□ -1.48
CCS1P40202 URH1YDR400W 1023 nt5.79□□□□□ -1.48
CCS1P40202 ASN2YGR124W 1719 nt5.79□□□□□ -1.48
CCS1P40202 APE4YHR113W 1473 nt5.78□□□□□ -1.48
CCS1P40202 CCT3YJL014W 1605 nt5.78□□□□□ -1.48
CCS1P40202 EFM1YHL039W 1758 nt5.78□□□□□ -1.48
CCS1P40202 YGL102CYGL102C 429 nt5.78□□□□□ -1.48
CCS1P40202 AIM46YHR199C 933 nt5.78□□□□□ -1.48
CCS1P40202 COX16YJL003W 357 nt5.78□□□□□ -1.48
CCS1P40202 YOX1YML027W 1158 nt5.78□□□□□ -1.48
CCS1P40202 LAT1YNL071W 1449 nt5.78□□□□□ -1.48
CCS1P40202 YDL177CYDL177C 513 nt5.77□□□□□ -1.49
CCS1P40202 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.77□□□□□ -1.49
CCS1P40202 RPL31BYLR406C 342 nt5.77□□□□□ -1.49
CCS1P40202 RPR1RPR1 369 nt5.77□□□□□ -1.49
CCS1P40202 SPG5YMR191W 1122 nt5.77□□□□□ -1.49
CCS1P40202 MRPL19YNL185C 477 nt5.77□□□□□ -1.49
CCS1P40202 YEN1YER041W 2280 nt5.77□□□□□ -1.49
CCS1P40202 RQC1YDR333C 2172 nt5.76□□□□□ -1.49
CCS1P40202 YIP4YGL198W 708 nt5.76□□□□□ -1.49
CCS1P40202 CBR1YIL043C 855 nt5.76□□□□□ -1.49
CCS1P40202 MEU1YLR017W 1014 nt5.76□□□□□ -1.49
CCS1P40202 ERG10YPL028W 1197 nt5.76□□□□□ -1.49
CCS1P40202 SMX3YPR182W 261 nt5.76□□□□□ -1.49
CCS1P40202 VTS1YOR359W 1572 nt5.76□□□□□ -1.49
CCS1P40202 GSH1YJL101C 2037 nt5.75□□□□□ -1.49
CCS1P40202 RGD2YFL047W 2145 nt5.75□□□□□ -1.49
CCS1P40202 YOS9YDR057W 1629 nt5.75□□□□□ -1.49
CCS1P40202 TRS31YDR472W 852 nt5.75□□□□□ -1.49
CCS1P40202 YLL056CYLL056C 897 nt5.75□□□□□ -1.49
CCS1P40202 YNR014WYNR014W 639 nt5.75□□□□□ -1.49
CCS1P40202 MRPS28YDR337W 861 nt5.74□□□□□ -1.49
CCS1P40202 OPI11YPR044C 354 nt5.74□□□□□ -1.49
CCS1P40202 CIR2YOR356W 1896 nt5.74□□□□□ -1.49
CCS1P40202 HOG1YLR113W 1308 nt5.74□□□□□ -1.49
CCS1P40202 ERG12YMR208W 1332 nt5.74□□□□□ -1.49
CCS1P40202 PPH22YDL188C 1134 nt5.73□□□□□ -1.49
CCS1P40202 GCN3YKR026C 918 nt5.73□□□□□ -1.49
CCS1P40202 YPR076WYPR076W 375 nt5.73□□□□□ -1.49
CCS1P40202 YLL058WYLL058W 1728 nt5.72□□□□□ -1.49
CCS1P40202 YSC83YHR017W 1158 nt5.72□□□□□ -1.49
CCS1P40202 PRI1YIR008C 1230 nt5.72□□□□□ -1.49
CCS1P40202 ATG36YJL185C 882 nt5.72□□□□□ -1.49
CCS1P40202 SML1YML058W 315 nt5.72□□□□□ -1.49
CCS1P40202 ICP55YER078C 1536 nt5.72□□□□□ -1.49
CCS1P40202 YJL163CYJL163C 1668 nt5.72□□□□□ -1.49
CCS1P40202 PPM2YOL141W 2088 nt5.71□□□□□ -1.49
CCS1P40202 TMA46YOR091W 1038 nt5.71□□□□□ -1.5
CCS1P40202 FIT2YOR382W 462 nt5.71□□□□□ -1.5
CCS1P40202 DAL7YIR031C 1665 nt5.71□□□□□ -1.5
CCS1P40202 SGE1YPR198W 1632 nt5.7□□□□□ -1.5
CCS1P40202 MFG1YDL233W 1377 nt5.7□□□□□ -1.5
CCS1P40202 YHR020WYHR020W 2067 nt5.7□□□□□ -1.5
CCS1P40202 HED1YDR014W-A 489 nt5.7□□□□□ -1.5
CCS1P40202 RRN10YBL025W 438 nt5.7□□□□□ -1.5
CCS1P40202 IRC11YOR013W 471 nt5.7□□□□□ -1.5
CCS1P40202 RPL5YPL131W 894 nt5.7□□□□□ -1.5
CCS1P40202 GPH1YPR160W 2709 nt5.7□□□□□ -1.5
CCS1P40202 YLL066CYLL066C 3618 nt5.69□□□□□ -1.5
CCS1P40202 FCY22YER060W-A 1593 nt5.69□□□□□ -1.5
CCS1P40202 CUE4YML101C 354 nt5.69□□□□□ -1.5
CCS1P40202 MSC3YLR219W 2187 nt5.69□□□□□ -1.5
CCS1P40202 PEX31YGR004W 1389 nt5.68□□□□□ -1.5
CCS1P40202 NUP49YGL172W 1419 nt5.68□□□□□ -1.5
CCS1P40202 AGX1YFL030W 1158 nt5.68□□□□□ -1.5
CCS1P40202 YJL144WYJL144W 315 nt5.68□□□□□ -1.5
CCS1P40202 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.68□□□□□ -1.5
CCS1P40202 OPI8YKR035C 642 nt5.68□□□□□ -1.5
CCS1P40202 SWD1YAR003W 1281 nt5.68□□□□□ -1.5
CCS1P40202 YOL046CYOL046C 675 nt5.68□□□□□ -1.5
CCS1P40202 LGE1YPL055C 999 nt5.68□□□□□ -1.5
CCS1P40202 SEC62YPL094C 825 nt5.68□□□□□ -1.5
CCS1P40202 SMK1YPR054W 1167 nt5.68□□□□□ -1.5
CCS1P40202 ADH5YBR145W 1056 nt5.68□□□□□ -1.5
CCS1P40202 PPH21YDL134C 1110 nt5.67□□□□□ -1.5
CCS1P40202 HIS1YER055C 894 nt5.67□□□□□ -1.5
CCS1P40202 DYS1YHR068W 1164 nt5.67□□□□□ -1.5
CCS1P40202 ZIM17YNL310C 525 nt5.67□□□□□ -1.5
CCS1P40202 MLS1YNL117W 1665 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 YDR415CYDR415C 1125 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.66□□□□□ -1.5
CCS1P40202 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.66□□□□□ -1.5
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