Protein–RNA interactions for Protein: P23610

F8A1, Factor VIII intron 22 protein, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8A1P23610 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8A1P23610 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8A1P23610 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8A1P23610 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8A1P23610 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8A1P23610 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8A1P23610 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
F8A1P23610 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8A1P23610 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
F8A1P23610 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
F8A1P23610 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8A1P23610 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8A1P23610 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
F8A1P23610 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8A1P23610 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
F8A1P23610 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8A1P23610 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8A1P23610 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8A1P23610 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
F8A1P23610 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F8A1P23610 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
F8A1P23610 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F8A1P23610 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
F8A1P23610 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
F8A1P23610 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8A1P23610 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8A1P23610 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8A1P23610 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8A1P23610 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
F8A1P23610 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8A1P23610 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8A1P23610 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8A1P23610 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8A1P23610 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8A1P23610 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8A1P23610 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8A1P23610 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8A1P23610 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8A1P23610 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8A1P23610 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8A1P23610 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8A1P23610 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F8A1P23610 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
F8A1P23610 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8A1P23610 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8A1P23610 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8A1P23610 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8A1P23610 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8A1P23610 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8A1P23610 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8A1P23610 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8A1P23610 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8A1P23610 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8A1P23610 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8A1P23610 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8A1P23610 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8A1P23610 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8A1P23610 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8A1P23610 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
F8A1P23610 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8A1P23610 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
F8A1P23610 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8A1P23610 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8A1P23610 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F8A1P23610 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F8A1P23610 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F8A1P23610 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
F8A1P23610 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F8A1P23610 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F8A1P23610 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F8A1P23610 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8A1P23610 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8A1P23610 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8A1P23610 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8A1P23610 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8A1P23610 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8A1P23610 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8A1P23610 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8A1P23610 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8A1P23610 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8A1P23610 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8A1P23610 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8A1P23610 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8A1P23610 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8A1P23610 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8A1P23610 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8A1P23610 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8A1P23610 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8A1P23610 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8A1P23610 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8A1P23610 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F8A1P23610 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F8A1P23610 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
F8A1P23610 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8A1P23610 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8A1P23610 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8A1P23610 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8A1P23610 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8A1P23610 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8A1P23610 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms