Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGB6P18564 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.2 ms