Protein–RNA interactions for Protein: P17936

IGFBP3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGFBP3P17936 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGFBP3P17936 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGFBP3P17936 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGFBP3P17936 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGFBP3P17936 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGFBP3P17936 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGFBP3P17936 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGFBP3P17936 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
IGFBP3P17936 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGFBP3P17936 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGFBP3P17936 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGFBP3P17936 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGFBP3P17936 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGFBP3P17936 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGFBP3P17936 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGFBP3P17936 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IGFBP3P17936 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGFBP3P17936 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGFBP3P17936 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGFBP3P17936 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGFBP3P17936 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGFBP3P17936 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGFBP3P17936 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGFBP3P17936 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGFBP3P17936 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGFBP3P17936 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGFBP3P17936 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGFBP3P17936 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGFBP3P17936 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGFBP3P17936 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGFBP3P17936 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IGFBP3P17936 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGFBP3P17936 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IGFBP3P17936 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGFBP3P17936 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGFBP3P17936 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms