Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GM2AP17900 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GM2AP17900 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GM2AP17900 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GM2AP17900 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GM2AP17900 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GM2AP17900 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GM2AP17900 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GM2AP17900 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GM2AP17900 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GM2AP17900 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GM2AP17900 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GM2AP17900 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GM2AP17900 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GM2AP17900 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GM2AP17900 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GM2AP17900 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GM2AP17900 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GM2AP17900 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GM2AP17900 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GM2AP17900 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GM2AP17900 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GM2AP17900 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GM2AP17900 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GM2AP17900 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GM2AP17900 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GM2AP17900 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GM2AP17900 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GM2AP17900 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GM2AP17900 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GM2AP17900 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GM2AP17900 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GM2AP17900 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GM2AP17900 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GM2AP17900 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GM2AP17900 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GM2AP17900 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GM2AP17900 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GM2AP17900 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GM2AP17900 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GM2AP17900 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GM2AP17900 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GM2AP17900 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GM2AP17900 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GM2AP17900 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GM2AP17900 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GM2AP17900 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GM2AP17900 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GM2AP17900 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GM2AP17900 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GM2AP17900 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GM2AP17900 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GM2AP17900 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GM2AP17900 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GM2AP17900 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GM2AP17900 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GM2AP17900 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GM2AP17900 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GM2AP17900 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GM2AP17900 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GM2AP17900 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GM2AP17900 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GM2AP17900 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GM2AP17900 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GM2AP17900 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GM2AP17900 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GM2AP17900 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GM2AP17900 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GM2AP17900 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GM2AP17900 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GM2AP17900 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GM2AP17900 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GM2AP17900 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GM2AP17900 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GM2AP17900 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GM2AP17900 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GM2AP17900 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GM2AP17900 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GM2AP17900 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GM2AP17900 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GM2AP17900 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GM2AP17900 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GM2AP17900 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GM2AP17900 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GM2AP17900 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GM2AP17900 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GM2AP17900 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GM2AP17900 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GM2AP17900 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GM2AP17900 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GM2AP17900 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GM2AP17900 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GM2AP17900 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GM2AP17900 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GM2AP17900 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GM2AP17900 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GM2AP17900 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GM2AP17900 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GM2AP17900 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GM2AP17900 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms