Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fgfr1P16092 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fgfr1P16092 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fgfr1P16092 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fgfr1P16092 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fgfr1P16092 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms