RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000143026.7

Cadm1-206, Transcript of Cell adhesion molecule 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Cadm1, Length 1,643 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa50,24■■■■■ 5,63
Cadm1-206ENSMUST00000143026 NischQ80TM9 1593 aa49,67■■■■■ 5,54
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Abcc9P70170 1546 aa48,11■■■■■ 5,29
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Abcc8B2RUS7 1588 aa47,93■■■■■ 5,26
Cadm1-206ENSMUST00000143026 ScribQ80U72 1612 aa46,02■■■■■ 4,96
Cadm1-206ENSMUST00000143026 NacadQ5SWP3 1504 aa44,63■■■■■ 4,73
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Kdm5dQ62240 1548 aa44,57■■■■■ 4,73
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Dcaf1Q80TR8 1506 aa44,25■■■■■ 4,67
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Sycp2Q9CUU3 1500 aa43,73■■■■■ 4,59
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa43,32■■■■■ 4,53
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Rhox8Q6VSS7 320 aa43,13■■■■■ 4,49
Cadm1-206ENSMUST00000143026 BicraF8VPZ9 1578 aa43,06■■■■■ 4,48
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Ccdc180J3QNE4 1664 aa42,86■■■■■ 4,45
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Baz1aO88379 1555 aa42,75■■■■■ 4,43
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Crybg2B7ZCC2 1516 aa42,58■■■■■ 4,41
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP42,01■■■■■ 4,32
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP41,81■■■■■ 4,28
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Smarca2Q6DIC0 1577 aa41,53■■■■■ 4,24
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP41,48■■■■■ 4,23
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP41,34■■■■■ 4,21
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa41,29■■■■■ 4,2
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP41,27■■■■■ 4,2
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Rtl1Q7M732 1744 aa41,22■■■■■ 4,19
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa41,21■■■■■ 4,19
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa41■■■■■ 4,15
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Ercc6F8VPZ5 1481 aa40,92■■■■■ 4,14
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40,67■■■■■ 4,1
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Wdr62Q3U3T8 1523 aa40,61■■■■■ 4,09
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Frmpd1A2AKB4 1549 aa40,53■■■■■ 4,08
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Fam135aQ6NS59 1506 aa40,47■■■■■ 4,07
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP40,37■■■■■ 4,05
Cadm1-206ENSMUST00000143026 CftrP26361 1476 aa40,37■■■■■ 4,05
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa40,35■■■■■ 4,05
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Synj1Q8CHC4 1574 aa40,31■■■■■ 4,04
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa40,31■■■■■ 4,04
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP40,23■■■■■ 4,03
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Baz1bQ9Z277 1479 aa40,09■■■■■ 4,01
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Unc13aQ4KUS2 1712 aa40,03■■■■■ 4
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Ubl4bQ9CQ84 188 aa39,8■■■■□ 3,96
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Trim41Q5NCC3 630 aa39,79■■■■□ 3,96
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP39,62■■■■□ 3,93
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Mrc2Q64449 1479 aa39,51■■■■□ 3,92
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP39,29■■■■□ 3,88
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Kif15Q6P9L6 1387 aa39,16■■■■□ 3,86
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Lamc3Q9R0B6 1581 aa39,14■■■■□ 3,86
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Cux2P70298 1426 aa39,07■■■■□ 3,85
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Golga3P55937 1487 aa39,05■■■■□ 3,84
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Top2bQ64511 1612 aa39,01■■■■□ 3,84
Cadm1-206ENSMUST00000143026 TnnQ80Z71 1560 aa38,81■■■■□ 3,8
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Cngb1E1AZ71 1325 aa38,81■■■■□ 3,8
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Kif21aQ9QXL2 1672 aa38,73■■■■□ 3,79
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP38,67■■■■□ 3,78
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa38,64■■■■□ 3,78
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Cep164Q5DU05 1446 aa38,6■■■■□ 3,77
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Fmn1Q05860 1466 aa38,57■■■■□ 3,77
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Ccdc18Q640L5 1455 aa38,56■■■■□ 3,76
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Camsap1A2AHC3 1581 aa38,47■■■■□ 3,75
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Il27Q8K3I6 234 aa38,34■■■■□ 3,73
Cadm1-206ENSMUST00000143026 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP38,29■■■■□ 3,72
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP38,28■■■■□ 3,72
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Crocc2F6XLV1 1638 aa38,14■■■■□ 3,7
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP38,12■■■■□ 3,69
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP38,11■■■■□ 3,69
Cadm1-206ENSMUST00000143026 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP38,09■■■■□ 3,69
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Plb1Q3TTY0 1478 aa38,08■■■■□ 3,69
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa38,06■■■■□ 3,68
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Grin2bQ01097 1482 aa37,97■■■■□ 3,67
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Duox2A2AQ99 1517 aa37,92■■■■□ 3,66
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP37,9■■■■□ 3,66
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Ift140E9PY46 1464 aa37,81■■■■□ 3,64
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Chic1Q8CBW7 227 aa37,78■■■■□ 3,64
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Efcab5A0JP43 1406 aa37,73■■■■□ 3,63
Cadm1-206ENSMUST00000143026 NrkQ9R0G8 1455 aa37,66■■■■□ 3,62
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Samd9lQ69Z37 1561 aa37,63■■■■□ 3,62
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Rusc2Q80U22 1514 aa37,6■■■■□ 3,61
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Disp1Q3TDN0 1521 aa37,57■■■■□ 3,6
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP37,5■■■■□ 3,59
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Shroom4Q1W617 1475 aa37,47■■■■□ 3,59
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Shroom2A2ALU4 1481 aa37,44■■■■□ 3,58
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Setd1bQ8CFT2 1985 aa37,42■■■■□ 3,58
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP37,41■■■■□ 3,58
Cadm1-206ENSMUST00000143026 HrcG5E8J6 738 aa37,4■■■■□ 3,58
Cadm1-206ENSMUST00000143026 PtprkP35822 1457 aa37,4■■■■□ 3,58
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa37,34■■■■□ 3,57
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Rad54l2Q99NG0 1466 aa37,33■■■■□ 3,57
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Grin2aP35436 1464 aa37,26■■■■□ 3,56
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Magi3Q9EQJ9 1476 aa37,26■■■■□ 3,56
Cadm1-206ENSMUST00000143026 SynmQ70IV5 1561 aa37,2■■■■□ 3,54
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Gpatch8A2A6A1 1505 aa37,13■■■■□ 3,53
Cadm1-206ENSMUST00000143026 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP37,11■■■■□ 3,53
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Pla2r1Q62028 1487 aa37,08■■■■□ 3,53
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Dnajc5P60904 198 aa37,07■■■■□ 3,53
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP37,07■■■■□ 3,52
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Zeb1Q64318 1117 aa37,01■■■■□ 3,52
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Npm2Q80W85 207 aa37,01■■■■□ 3,52
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa36,99■■■■□ 3,51
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa36,88■■■■□ 3,49
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Fgd6Q69ZL1 1399 aa36,87■■■■□ 3,49
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Gab3Q8BSM5 595 aa36,86■■■■□ 3,49
Cadm1-206ENSMUST00000143026 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP36,85■■■■□ 3,49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 60,4 ms