RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000114751.8

Htatsf1-202, Transcript of HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Htatsf1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa50,4■■■■■ 5,66
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Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Abcc8B2RUS7 1588 aa48,08■■■■■ 5,29
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 ScribQ80U72 1612 aa46,37■■■■■ 5,01
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 NacadQ5SWP3 1504 aa44,92■■■■■ 4,78
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Kdm5dQ62240 1548 aa44,83■■■■■ 4,77
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Dcaf1Q80TR8 1506 aa44,25■■■■■ 4,67
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Sycp2Q9CUU3 1500 aa44,04■■■■■ 4,64
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 BicraF8VPZ9 1578 aa43,43■■■■■ 4,54
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa43,33■■■■■ 4,53
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Rhox8Q6VSS7 320 aa42,94■■■■■ 4,46
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Ccdc180J3QNE4 1664 aa42,75■■■■■ 4,43
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Baz1aO88379 1555 aa42,73■■■■■ 4,43
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Crybg2B7ZCC2 1516 aa42,61■■■■■ 4,41
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Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa42,23■■■■■ 4,35
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP42,1■■■■■ 4,33
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP41,87■■■■■ 4,29
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP41,83■■■■■ 4,29
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP41,47■■■■■ 4,23
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Smarca2Q6DIC0 1577 aa41,47■■■■■ 4,23
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa41,35■■■■■ 4,21
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Ercc6F8VPZ5 1481 aa41,33■■■■■ 4,21
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa41,25■■■■■ 4,19
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa41,2■■■■■ 4,19
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Fam135aQ6NS59 1506 aa40,93■■■■■ 4,14
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Wdr62Q3U3T8 1523 aa40,9■■■■■ 4,14
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Frmpd1A2AKB4 1549 aa40,85■■■■■ 4,13
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Rtl1Q7M732 1744 aa40,83■■■■■ 4,13
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP40,64■■■■■ 4,1
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Htatsf1-202ENSMUST00000114751 CftrP26361 1476 aa40,42■■■■■ 4,06
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa40,38■■■■■ 4,05
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Synj1Q8CHC4 1574 aa40,33■■■■■ 4,05
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP40,32■■■■■ 4,04
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Unc13aQ4KUS2 1712 aa40,3■■■■■ 4,04
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Ubl4bQ9CQ84 188 aa40,27■■■■■ 4,04
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa40,2■■■■■ 4,03
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Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Trim41Q5NCC3 630 aa39,63■■■■□ 3,93
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP39,47■■■■□ 3,91
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Kif15Q6P9L6 1387 aa39,38■■■■□ 3,89
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Cux2P70298 1426 aa39,37■■■■□ 3,89
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Lamc3Q9R0B6 1581 aa39,25■■■■□ 3,87
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa39,09■■■■□ 3,85
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Kif21aQ9QXL2 1672 aa39,06■■■■□ 3,84
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP38,97■■■■□ 3,83
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Golga3P55937 1487 aa38,89■■■■□ 3,82
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Top2bQ64511 1612 aa38,86■■■■□ 3,81
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Cep164Q5DU05 1446 aa38,83■■■■□ 3,81
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 TnnQ80Z71 1560 aa38,8■■■■□ 3,8
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Cngb1E1AZ71 1325 aa38,71■■■■□ 3,79
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Ccdc18Q640L5 1455 aa38,66■■■■□ 3,78
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Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP38,54■■■■□ 3,76
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Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Camsap1A2AHC3 1581 aa38,53■■■■□ 3,76
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Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP38,46■■■■□ 3,75
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Fmn1Q05860 1466 aa38,46■■■■□ 3,75
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Plb1Q3TTY0 1478 aa38,41■■■■□ 3,74
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Crocc2F6XLV1 1638 aa38,35■■■■□ 3,73
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Dnajc5P60904 198 aa38,26■■■■□ 3,72
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP38,25■■■■□ 3,71
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Ift140E9PY46 1464 aa38,09■■■■□ 3,69
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Shroom2A2ALU4 1481 aa38,07■■■■□ 3,68
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Duox2A2AQ99 1517 aa38,07■■■■□ 3,68
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Grin2bQ01097 1482 aa38,01■■■■□ 3,67
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Rusc2Q80U22 1514 aa37,93■■■■□ 3,66
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa37,83■■■■□ 3,65
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Disp1Q3TDN0 1521 aa37,81■■■■□ 3,64
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Efcab5A0JP43 1406 aa37,79■■■■□ 3,64
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Samd9lQ69Z37 1561 aa37,75■■■■□ 3,63
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP37,71■■■■□ 3,63
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP37,7■■■■□ 3,63
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP37,67■■■■□ 3,62
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Setd1bQ8CFT2 1985 aa37,65■■■■□ 3,62
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP37,64■■■■□ 3,62
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 NrkQ9R0G8 1455 aa37,6■■■■□ 3,61
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa37,6■■■■□ 3,61
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Chic1Q8CBW7 227 aa37,56■■■■□ 3,6
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Col17a1Q07563 1470 aa37,53■■■■□ 3,6
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Rad54l2Q99NG0 1466 aa37,51■■■■□ 3,59
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP37,46■■■■□ 3,59
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Shroom4Q1W617 1475 aa37,42■■■■□ 3,58
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Grin2aP35436 1464 aa37,41■■■■□ 3,58
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Htatsf1-202ENSMUST00000114751 PtprkP35822 1457 aa37,38■■■■□ 3,57
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP37,33■■■■□ 3,57
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 SynmQ70IV5 1561 aa37,23■■■■□ 3,55
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP37,21■■■■□ 3,55
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Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Gpatch8A2A6A1 1505 aa37,19■■■■□ 3,54
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Pla2r1Q62028 1487 aa37,19■■■■□ 3,54
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Zeb1Q64318 1117 aa37,06■■■■□ 3,52
Htatsf1-202ENSMUST00000114751 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa36,92■■■■□ 3,5
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Htatsf1-202ENSMUST00000114751 AknaQ80VW7 1404 aa36,9■■■■□ 3,5
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