Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB3P14651 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXB3P14651 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB3P14651 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB3P14651 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms