Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEPDP12955 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEPDP12955 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEPDP12955 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEPDP12955 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEPDP12955 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEPDP12955 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEPDP12955 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEPDP12955 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEPDP12955 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEPDP12955 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEPDP12955 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEPDP12955 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEPDP12955 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEPDP12955 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEPDP12955 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEPDP12955 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEPDP12955 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PEPDP12955 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEPDP12955 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEPDP12955 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEPDP12955 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEPDP12955 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEPDP12955 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEPDP12955 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEPDP12955 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEPDP12955 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEPDP12955 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEPDP12955 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEPDP12955 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEPDP12955 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEPDP12955 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PEPDP12955 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEPDP12955 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEPDP12955 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEPDP12955 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEPDP12955 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEPDP12955 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEPDP12955 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PEPDP12955 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEPDP12955 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEPDP12955 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEPDP12955 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEPDP12955 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEPDP12955 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEPDP12955 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEPDP12955 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PEPDP12955 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEPDP12955 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEPDP12955 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEPDP12955 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEPDP12955 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEPDP12955 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEPDP12955 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEPDP12955 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEPDP12955 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEPDP12955 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEPDP12955 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEPDP12955 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEPDP12955 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEPDP12955 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEPDP12955 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEPDP12955 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEPDP12955 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEPDP12955 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEPDP12955 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEPDP12955 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEPDP12955 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEPDP12955 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEPDP12955 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEPDP12955 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEPDP12955 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEPDP12955 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEPDP12955 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEPDP12955 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEPDP12955 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEPDP12955 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEPDP12955 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEPDP12955 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PEPDP12955 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEPDP12955 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEPDP12955 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEPDP12955 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEPDP12955 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PEPDP12955 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEPDP12955 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEPDP12955 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEPDP12955 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEPDP12955 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEPDP12955 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEPDP12955 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEPDP12955 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEPDP12955 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEPDP12955 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEPDP12955 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEPDP12955 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEPDP12955 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEPDP12955 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEPDP12955 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEPDP12955 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms