Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VDRP11473 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VDRP11473 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VDRP11473 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VDRP11473 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VDRP11473 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VDRP11473 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VDRP11473 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VDRP11473 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VDRP11473 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VDRP11473 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VDRP11473 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VDRP11473 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VDRP11473 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VDRP11473 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VDRP11473 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VDRP11473 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VDRP11473 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VDRP11473 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VDRP11473 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VDRP11473 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VDRP11473 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VDRP11473 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VDRP11473 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VDRP11473 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VDRP11473 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VDRP11473 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VDRP11473 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VDRP11473 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VDRP11473 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VDRP11473 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VDRP11473 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VDRP11473 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VDRP11473 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VDRP11473 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VDRP11473 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VDRP11473 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VDRP11473 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
VDRP11473 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VDRP11473 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VDRP11473 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VDRP11473 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VDRP11473 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VDRP11473 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VDRP11473 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VDRP11473 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VDRP11473 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VDRP11473 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VDRP11473 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VDRP11473 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VDRP11473 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VDRP11473 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VDRP11473 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VDRP11473 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VDRP11473 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VDRP11473 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VDRP11473 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VDRP11473 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VDRP11473 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VDRP11473 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VDRP11473 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VDRP11473 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VDRP11473 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VDRP11473 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VDRP11473 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VDRP11473 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
VDRP11473 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VDRP11473 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VDRP11473 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VDRP11473 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VDRP11473 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VDRP11473 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VDRP11473 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VDRP11473 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VDRP11473 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VDRP11473 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VDRP11473 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VDRP11473 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VDRP11473 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VDRP11473 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VDRP11473 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VDRP11473 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VDRP11473 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VDRP11473 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VDRP11473 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VDRP11473 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VDRP11473 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VDRP11473 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VDRP11473 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VDRP11473 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VDRP11473 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VDRP11473 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VDRP11473 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VDRP11473 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VDRP11473 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VDRP11473 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VDRP11473 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VDRP11473 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VDRP11473 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VDRP11473 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms