Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OPN1MW3P0DN78 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
OPN1MW3P0DN78 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
OPN1MW3P0DN78 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms