Protein–RNA interactions for Protein: P07954

FH, Fumarate hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHP07954 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FHP07954 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FHP07954 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FHP07954 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FHP07954 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FHP07954 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FHP07954 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FHP07954 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FHP07954 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FHP07954 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FHP07954 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FHP07954 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FHP07954 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FHP07954 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FHP07954 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FHP07954 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FHP07954 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FHP07954 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FHP07954 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FHP07954 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FHP07954 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FHP07954 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FHP07954 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FHP07954 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FHP07954 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FHP07954 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FHP07954 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FHP07954 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FHP07954 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FHP07954 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FHP07954 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FHP07954 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FHP07954 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FHP07954 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FHP07954 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FHP07954 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FHP07954 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FHP07954 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FHP07954 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FHP07954 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FHP07954 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FHP07954 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FHP07954 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FHP07954 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FHP07954 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FHP07954 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FHP07954 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FHP07954 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FHP07954 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FHP07954 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHP07954 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHP07954 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FHP07954 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHP07954 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHP07954 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHP07954 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FHP07954 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHP07954 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHP07954 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHP07954 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FHP07954 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHP07954 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHP07954 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHP07954 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FHP07954 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FHP07954 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FHP07954 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FHP07954 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FHP07954 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FHP07954 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FHP07954 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FHP07954 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FHP07954 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FHP07954 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FHP07954 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FHP07954 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FHP07954 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FHP07954 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FHP07954 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FHP07954 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FHP07954 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FHP07954 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FHP07954 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FHP07954 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FHP07954 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FHP07954 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FHP07954 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FHP07954 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FHP07954 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FHP07954 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FHP07954 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FHP07954 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FHP07954 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FHP07954 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FHP07954 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FHP07954 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FHP07954 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FHP07954 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FHP07954 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FHP07954 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms