Protein–RNA interactions for Protein: P05787

KRT8, Keratin, type II cytoskeletal 8, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT8P05787 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT8P05787 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT8P05787 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT8P05787 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT8P05787 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT8P05787 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT8P05787 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT8P05787 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT8P05787 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT8P05787 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT8P05787 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT8P05787 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT8P05787 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT8P05787 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT8P05787 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT8P05787 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT8P05787 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT8P05787 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT8P05787 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT8P05787 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT8P05787 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT8P05787 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT8P05787 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT8P05787 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT8P05787 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT8P05787 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT8P05787 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT8P05787 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRT8P05787 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT8P05787 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT8P05787 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT8P05787 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT8P05787 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT8P05787 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT8P05787 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT8P05787 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRT8P05787 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT8P05787 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT8P05787 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT8P05787 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT8P05787 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT8P05787 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT8P05787 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT8P05787 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT8P05787 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT8P05787 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT8P05787 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT8P05787 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT8P05787 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT8P05787 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT8P05787 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT8P05787 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT8P05787 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT8P05787 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT8P05787 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT8P05787 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT8P05787 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT8P05787 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT8P05787 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT8P05787 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT8P05787 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT8P05787 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT8P05787 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT8P05787 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT8P05787 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT8P05787 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT8P05787 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT8P05787 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT8P05787 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT8P05787 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT8P05787 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT8P05787 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT8P05787 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT8P05787 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT8P05787 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT8P05787 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT8P05787 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT8P05787 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT8P05787 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT8P05787 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT8P05787 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT8P05787 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT8P05787 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT8P05787 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT8P05787 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT8P05787 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT8P05787 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT8P05787 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT8P05787 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT8P05787 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT8P05787 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT8P05787 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT8P05787 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT8P05787 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT8P05787 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT8P05787 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT8P05787 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT8P05787 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT8P05787 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT8P05787 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms