Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F13BP05160 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F13BP05160 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F13BP05160 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F13BP05160 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F13BP05160 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F13BP05160 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F13BP05160 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F13BP05160 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F13BP05160 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F13BP05160 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F13BP05160 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F13BP05160 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F13BP05160 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F13BP05160 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F13BP05160 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
F13BP05160 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F13BP05160 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F13BP05160 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F13BP05160 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F13BP05160 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F13BP05160 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
F13BP05160 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F13BP05160 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F13BP05160 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F13BP05160 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
F13BP05160 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F13BP05160 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F13BP05160 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
F13BP05160 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F13BP05160 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F13BP05160 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F13BP05160 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F13BP05160 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F13BP05160 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F13BP05160 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F13BP05160 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F13BP05160 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
F13BP05160 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F13BP05160 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
F13BP05160 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
F13BP05160 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
F13BP05160 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F13BP05160 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
F13BP05160 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F13BP05160 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F13BP05160 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
F13BP05160 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
F13BP05160 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F13BP05160 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
F13BP05160 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
F13BP05160 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
F13BP05160 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
F13BP05160 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
F13BP05160 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
F13BP05160 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
F13BP05160 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
F13BP05160 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F13BP05160 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
F13BP05160 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
F13BP05160 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F13BP05160 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F13BP05160 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
F13BP05160 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F13BP05160 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F13BP05160 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F13BP05160 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F13BP05160 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F13BP05160 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F13BP05160 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F13BP05160 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F13BP05160 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F13BP05160 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F13BP05160 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F13BP05160 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F13BP05160 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F13BP05160 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F13BP05160 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F13BP05160 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
F13BP05160 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
F13BP05160 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F13BP05160 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F13BP05160 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
F13BP05160 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
F13BP05160 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F13BP05160 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
F13BP05160 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
F13BP05160 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
F13BP05160 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
F13BP05160 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
F13BP05160 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
F13BP05160 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
F13BP05160 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F13BP05160 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F13BP05160 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
F13BP05160 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
F13BP05160 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
F13BP05160 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F13BP05160 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
F13BP05160 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms