Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAMEF12O95522 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF12O95522 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRAMEF12O95522 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF12O95522 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms