Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC2O95409 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZIC2O95409 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZIC2O95409 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZIC2O95409 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms