Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNKO75909 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNKO75909 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNKO75909 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNKO75909 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNKO75909 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNKO75909 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNKO75909 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNKO75909 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNKO75909 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNKO75909 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCNKO75909 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNKO75909 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNKO75909 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNKO75909 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNKO75909 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNKO75909 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNKO75909 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNKO75909 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNKO75909 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNKO75909 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNKO75909 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNKO75909 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNKO75909 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNKO75909 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNKO75909 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNKO75909 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNKO75909 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNKO75909 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNKO75909 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNKO75909 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNKO75909 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNKO75909 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNKO75909 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNKO75909 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNKO75909 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNKO75909 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNKO75909 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNKO75909 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNKO75909 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNKO75909 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNKO75909 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNKO75909 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNKO75909 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNKO75909 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNKO75909 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNKO75909 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNKO75909 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNKO75909 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNKO75909 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNKO75909 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNKO75909 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNKO75909 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNKO75909 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNKO75909 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNKO75909 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNKO75909 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNKO75909 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNKO75909 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNKO75909 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNKO75909 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNKO75909 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNKO75909 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNKO75909 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNKO75909 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNKO75909 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNKO75909 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNKO75909 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNKO75909 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCNKO75909 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNKO75909 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNKO75909 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNKO75909 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNKO75909 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNKO75909 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCNKO75909 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNKO75909 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNKO75909 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCNKO75909 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNKO75909 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNKO75909 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNKO75909 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNKO75909 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNKO75909 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNKO75909 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNKO75909 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNKO75909 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNKO75909 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCNKO75909 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNKO75909 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNKO75909 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNKO75909 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCNKO75909 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNKO75909 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNKO75909 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNKO75909 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCNKO75909 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNKO75909 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNKO75909 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCNKO75909 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms