Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPFIA3O75145 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPFIA3O75145 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PPFIA3O75145 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA3O75145 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms