Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP8B3O60423 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP8B3O60423 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATP8B3O60423 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATP8B3O60423 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms