Protein–RNA interactions for Protein: O60341

KDM1A, Lysine-specific histone demethylase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1AO60341 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM1AO60341 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM1AO60341 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KDM1AO60341 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM1AO60341 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM1AO60341 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM1AO60341 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM1AO60341 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KDM1AO60341 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KDM1AO60341 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM1AO60341 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM1AO60341 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KDM1AO60341 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM1AO60341 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM1AO60341 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KDM1AO60341 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms