Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRP9O43818 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRP9O43818 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRP9O43818 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RRP9O43818 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP9O43818 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP9O43818 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP9O43818 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP9O43818 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RRP9O43818 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP9O43818 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP9O43818 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RRP9O43818 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP9O43818 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP9O43818 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RRP9O43818 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP9O43818 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP9O43818 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP9O43818 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RRP9O43818 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP9O43818 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP9O43818 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRP9O43818 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRP9O43818 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP9O43818 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP9O43818 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP9O43818 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP9O43818 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP9O43818 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP9O43818 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP9O43818 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP9O43818 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRP9O43818 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP9O43818 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP9O43818 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRP9O43818 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP9O43818 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP9O43818 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP9O43818 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP9O43818 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP9O43818 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP9O43818 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP9O43818 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP9O43818 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRP9O43818 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP9O43818 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP9O43818 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP9O43818 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RRP9O43818 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP9O43818 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP9O43818 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP9O43818 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP9O43818 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP9O43818 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RRP9O43818 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP9O43818 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP9O43818 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRP9O43818 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RRP9O43818 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP9O43818 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP9O43818 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RRP9O43818 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP9O43818 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP9O43818 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP9O43818 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP9O43818 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP9O43818 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRP9O43818 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP9O43818 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP9O43818 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP9O43818 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP9O43818 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP9O43818 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP9O43818 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP9O43818 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RRP9O43818 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRP9O43818 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP9O43818 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP9O43818 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP9O43818 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RRP9O43818 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRP9O43818 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RRP9O43818 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRP9O43818 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP9O43818 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP9O43818 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRP9O43818 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP9O43818 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP9O43818 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP9O43818 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RRP9O43818 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP9O43818 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP9O43818 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP9O43818 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP9O43818 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP9O43818 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP9O43818 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP9O43818 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP9O43818 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP9O43818 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms