Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRID2O43424 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRID2O43424 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRID2O43424 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRID2O43424 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRID2O43424 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRID2O43424 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRID2O43424 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GRID2O43424 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRID2O43424 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRID2O43424 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRID2O43424 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRID2O43424 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRID2O43424 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRID2O43424 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRID2O43424 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRID2O43424 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRID2O43424 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRID2O43424 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRID2O43424 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRID2O43424 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRID2O43424 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRID2O43424 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRID2O43424 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRID2O43424 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRID2O43424 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRID2O43424 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRID2O43424 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRID2O43424 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRID2O43424 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRID2O43424 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRID2O43424 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRID2O43424 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRID2O43424 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRID2O43424 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GRID2O43424 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRID2O43424 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRID2O43424 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRID2O43424 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRID2O43424 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRID2O43424 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRID2O43424 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRID2O43424 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRID2O43424 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRID2O43424 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRID2O43424 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRID2O43424 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRID2O43424 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRID2O43424 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRID2O43424 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GRID2O43424 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRID2O43424 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRID2O43424 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRID2O43424 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRID2O43424 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRID2O43424 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRID2O43424 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GRID2O43424 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRID2O43424 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRID2O43424 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GRID2O43424 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRID2O43424 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRID2O43424 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRID2O43424 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRID2O43424 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRID2O43424 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRID2O43424 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRID2O43424 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRID2O43424 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRID2O43424 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRID2O43424 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRID2O43424 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRID2O43424 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRID2O43424 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRID2O43424 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRID2O43424 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRID2O43424 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRID2O43424 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRID2O43424 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRID2O43424 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GRID2O43424 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRID2O43424 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GRID2O43424 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRID2O43424 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRID2O43424 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRID2O43424 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRID2O43424 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRID2O43424 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRID2O43424 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRID2O43424 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRID2O43424 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GRID2O43424 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRID2O43424 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRID2O43424 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRID2O43424 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRID2O43424 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRID2O43424 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRID2O43424 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRID2O43424 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRID2O43424 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 684.7 ms