Protein–RNA interactions for Protein: O15234

CASC3, Protein CASC3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3O15234 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC3O15234 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC3O15234 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC3O15234 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC3O15234 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC3O15234 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC3O15234 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC3O15234 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC3O15234 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC3O15234 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASC3O15234 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC3O15234 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC3O15234 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC3O15234 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC3O15234 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASC3O15234 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASC3O15234 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC3O15234 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC3O15234 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC3O15234 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC3O15234 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASC3O15234 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC3O15234 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC3O15234 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC3O15234 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC3O15234 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC3O15234 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC3O15234 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC3O15234 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASC3O15234 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC3O15234 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC3O15234 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC3O15234 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC3O15234 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC3O15234 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASC3O15234 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC3O15234 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC3O15234 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC3O15234 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC3O15234 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASC3O15234 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC3O15234 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC3O15234 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC3O15234 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC3O15234 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC3O15234 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC3O15234 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASC3O15234 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC3O15234 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC3O15234 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASC3O15234 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC3O15234 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC3O15234 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC3O15234 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC3O15234 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASC3O15234 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC3O15234 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC3O15234 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC3O15234 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CASC3O15234 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC3O15234 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC3O15234 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC3O15234 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC3O15234 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC3O15234 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASC3O15234 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC3O15234 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC3O15234 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC3O15234 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC3O15234 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC3O15234 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC3O15234 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASC3O15234 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASC3O15234 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC3O15234 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC3O15234 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC3O15234 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC3O15234 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC3O15234 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASC3O15234 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC3O15234 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASC3O15234 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASC3O15234 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASC3O15234 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASC3O15234 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASC3O15234 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASC3O15234 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASC3O15234 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASC3O15234 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASC3O15234 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASC3O15234 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASC3O15234 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASC3O15234 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASC3O15234 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASC3O15234 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASC3O15234 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASC3O15234 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASC3O15234 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASC3O15234 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASC3O15234 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms