Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF4O00268 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF4O00268 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF4O00268 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF4O00268 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF4O00268 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF4O00268 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF4O00268 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF4O00268 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF4O00268 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF4O00268 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF4O00268 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF4O00268 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF4O00268 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF4O00268 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF4O00268 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF4O00268 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF4O00268 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4O00268 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4O00268 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4O00268 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4O00268 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF4O00268 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4O00268 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4O00268 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4O00268 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4O00268 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4O00268 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TAF4O00268 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4O00268 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4O00268 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF4O00268 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF4O00268 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF4O00268 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF4O00268 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF4O00268 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF4O00268 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF4O00268 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF4O00268 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF4O00268 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4O00268 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4O00268 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4O00268 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4O00268 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4O00268 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4O00268 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TAF4O00268 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF4O00268 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF4O00268 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF4O00268 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TAF4O00268 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4O00268 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4O00268 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4O00268 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4O00268 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4O00268 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4O00268 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TAF4O00268 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF4O00268 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF4O00268 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF4O00268 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF4O00268 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TAF4O00268 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF4O00268 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF4O00268 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF4O00268 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF4O00268 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF4O00268 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF4O00268 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF4O00268 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF4O00268 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF4O00268 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TAF4O00268 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF4O00268 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF4O00268 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF4O00268 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF4O00268 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF4O00268 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF4O00268 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TAF4O00268 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF4O00268 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF4O00268 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF4O00268 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF4O00268 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF4O00268 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TAF4O00268 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF4O00268 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF4O00268 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF4O00268 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF4O00268 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TAF4O00268 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF4O00268 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF4O00268 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF4O00268 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF4O00268 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF4O00268 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF4O00268 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF4O00268 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAF4O00268 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAF4O00268 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms