Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCER2I3L3R5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCER2I3L3R5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCER2I3L3R5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCER2I3L3R5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCER2I3L3R5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms