Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AGAP5A6NIR3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGAP5A6NIR3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
AGAP5A6NIR3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AGAP5A6NIR3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms