Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM247A6NEH6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM247A6NEH6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM247A6NEH6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM247A6NEH6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms