Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0J9YVX5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
A0A0J9YVX5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A0A0J9YVX5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0J9YVX5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0J9YVX5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0J9YVX5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0J9YVX5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0J9YVX5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0J9YVX5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A0J9YVX5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0J9YVX5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0J9YVX5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms