Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JMD5

PRAMEF33, PRAME family member 33, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms